研究论文
孙翔宇1, 2, 龚诗琦1, 2, 罗玉松1, 2, 张成桃1, 2, 宋慧娟1, 2, 孙龙俊3, 何长征1, 2, 汤冰倩1, 2, 孙小武1, 2, 戴思慧1, 2
摘 要:通过生物信息学方法对西瓜ERECTA 基因(基因ID 为Cla97C05G096750)的理化性质、保守结构域、跨膜结构域、蛋白质二级和三级结构进行分析,并进行系统进化树聚类分析,克隆西瓜ERECTA 基因CDS 序列全长,并对该基因组织特异性表达与非生物胁迫下的表达模式进行分析。结果表明,西瓜ERECTA 基因序列全长为6 894 bp,包含27 个外显子,26 个内含子,位于第5 号染色体的25 867 785~25 874 678 bp 区域,编码991 个氨基酸。系统进化树分析表明,该氨基酸序列与甜瓜、黄瓜亲缘关系较近,同水稻的亲缘关系最远;qRT-PCR 结果显示,ERECTA 基因在雌花和叶片中表达量较高,在茎中表达量最低,在盐胁迫下上调表达,在干旱和低温胁迫下表达呈先升后降趋势,推测其在逆境胁迫中发挥作用。本研究可为后续西瓜中该基因功能的研究及定向改良西瓜重要农艺性状提供参考。