研究论文
班国梁1, 2, 曹亚从2, 张正海2, 于海龙2, 吴华茂2, 李戎轩2, 赵红2, 张伟丽2, 聂智星3, 宋红霞1, 王立浩2
摘 要:辣椒红色素是目前全球销量最大的纯天然可食用色素,培育高辣椒红色素品种为辣椒产业重要任务。通过对255份一年生栽培种辣椒核心种质的辣椒红素含量进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),在第1、2、3、5、6、8、9、10、11 和12 号染色体均关联到与辣椒红素含量显著相关的区间,关联区间内共包括93 个基因,根据功能注释和转录表达数据预测了3 个影响辣椒果实中辣椒红素含量的候选基因。通过对高辣椒红色素材料Pep-340、低辣椒红色素材料Pep-276 构建的F2 群体进行混合分组分析法- 测序(bulked segregant analysis-sequencing,BSA-seq)分析, 在第1、3、5 和10 号染色体定位到与辣椒红色素含量相关区间,其中第3 和5 号染色体上的定位区间与GWAS 分析中的显著相关区间相近或重合;利用这两个区间的InDel 分子标记,进行遗传连锁分析,将调控辣椒红色素含量基因定位在3 号染色体的qCC3.1,物理位置为 22.8~25.9 Mb,其中含有99 个基因,根据功能注释和转录组分析,预测了4 个影响辣椒果实中辣椒红色素含量的候选基因Capana03g001314、Capana03g001325、Capana03g001334 和Capana03g001387。研究结果为调控辣椒中辣椒红色素含量基因精细定位及分子标记辅助选择育种奠定基础。