两个甘蓝自交系自交不亲和S单元型的初步鉴定
田磊，庄木，刘玉梅，杨丽梅，张扬勇，方智远
中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京 100081
Preliminary Identification of S Haplotypes of Two Self-incompatible Lines in Cabbage（Brassica oleracea var. capitata L.）
TIAN Lei, ZHUANG Mu*, LIU Yu-mei, YANG Li-mei, ZHANG Yang-yong, FANG Zhi-yuan
Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China
摘要 根据甘蓝SRK基因序列保守区设计特异性引物，通过PCR扩增和克隆测序，结合生物信息学分析方法对两个甘蓝自交系材料的S单元型进行初步鉴定。BLAST分析表明：甘蓝自交系96-100与Brassica oleracea的SRK29基因核苷酸序列相似性最高（91 %），但蛋白序列与S14相似性最高（在84 %的序列覆盖度下相似性达100 %）。自交系俄引165与Brassica oleracea的BoSRK28基因核苷酸序列相似性达100 %，推测其S单元型为S28。
关键词 ：
甘蓝 ,
自交不亲和性 ,
S单元型 ,
SRK基因
Abstract ：According to the conserved sequence of S locus kinase（SRK）gene in cabbage（Brassica oleracea var. capitata L.）, a pair of SRK-specific primers was designed. The S haplotypes of 2 inbred lines in cabbage were identified by PCR amplification and DNA sequencing, combined with bio-informatics analysis. BLAST results indicated that the self-incompatible line 96-100 showed 91 % similarity in nucleotide sequence with SRK29 gene in cabbage, and 100 % similarity under 84 % query coverage of protein residue with S14 haplotype in cabbage, while the self-incompatible line Eyin165 exhibited 100 % similarity in nucleotide sequence with BoSRK28 gene in cabbage. This indicated that S haplotype of Eyin165 is S28.
Key words ：
Cabbage
Self-incompatibility
S haplotype
SRK gene
收稿日期: 2010-12-15
引用本文:
田磊;庄木;刘玉梅;杨丽梅;张扬勇;方智远. 两个甘蓝自交系自交不亲和S单元型的初步鉴定[J]. 中国蔬菜, 2011, 1(4): 8-12.
TIAN Lei;ZHUANG Mu*;LIU Yu-mei;YANG Li-mei;ZHANG Yang-yong;FANG Zhi-yuan. Preliminary Identification of S Haplotypes of Two Self-incompatible Lines in Cabbage（Brassica oleracea var. capitata L.）. , 2011, 1(4): 8-12.
链接本文:
http://www.cnveg.org/CN/ 或 http://www.cnveg.org/CN/Y2011/V1/I4/8
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