番茄品种SSR 标记鉴定技术研究
赵海艳,吴明生* ,宋歌,牛茜,田慧芳
(北京市种子管理站,北京100088)
Studies on Tomato Variety Identification Technology Using SSR Marker
ZHAO Hai-yan,WU Ming-sheng* ,SONG-Ge,NIU-Qian,TIAN Hui-fang
(Beijing Seed Administration Station,Beijing 100088,China)
摘要 以16 个番茄品种为材料,从200 对番茄SSR 引物中筛选出20 对适合用于番茄品种鉴定的引物,用该20 对引物对66 个番茄品种进行分析,共检测出52 个等位基因变异,等位基因变异范围为2~5 个,平均每个位点产生2.6 个等位基因变异。通过遗传聚类方法对引物组合的品种鉴别能力进行分析,结果显示仅用9 对引物构成的引物组合就可以对66 个番茄品:番茄;SSR;品种鉴定;指纹图谱种进行有效鉴别,该9 对引物组合构建的SSR-DNA 指纹图谱可作为品种的遗传标签用于品种真伪鉴定。
关键词 :
番茄 ,
SSR ,
品种鉴定 ,
指纹图谱
Abstract :Taking 16 tomato hybrid varieties as material,20 pairs of primer suited for tomato variety identification were screened from 200 pairs of SSR primer,and 66 tomato varieties were analyzed. 52 allelic gene variations were identified among these varieties. The allelic gene variation was in the range of 2-5,with an average of 2.6 allelic gene variation each locus. The cultivar identification ability of primer combination was analyzed by genetic clustering method. The results showed that the 66 tomato varieties could be efficiently identified by only 9 pairs of SSR primer. The SSR-DNA fingerprinting constructed with these 9 pairs of primer combination could be used as genetic tag for variety authenticity identification.
Key words :
Tomato
SSR
Variety identification
Fingerprinting
收稿日期: 2014-06-06
基金资助: 北京市科技计划项目(D131100000413001)
通讯作者:
吴明生,男,高级农艺师,专业方向:种子质量检测,E-mail:chpwcx2010@sina.com
作者简介 : 赵海艳,女,硕士,农艺师,专业方向:种子质量检测,E-mail:zhaoh_yan@163.com
引用本文:
赵海艳, 吴明生, 宋歌, 牛茜, 田慧芳. 番茄品种SSR 标记鉴定技术研究[J]. 中国蔬菜, 2015, 1(8): 22-27.
ZHAO Hai-Yan, WU Ming-Sheng, SONG Ge, NIU Qian, TIAN Hui-Fang. Studies on Tomato Variety Identification Technology Using SSR Marker. , 2015, 1(8): 22-27.
链接本文:
https://www.cnveg.org/CN/ 或 https://www.cnveg.org/CN/Y2015/V1/I8/22
[1]
蓝达愉,李凤芳,何广洁,许萌杏,吴小刚,黎起秦,林纬,袁高庆. 番茄立枯病菌拮抗菌B4-8的鉴定及生防作用评价 [J]. 中国蔬菜, 2022, 1(1): 82-88.
[2]
欧阳娴,白占兵,张松柏,史晓斌,郑立敏,周晓迅,谭放军,张战泓. 番茄新品种钻红美丽的选育 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(9): 91-93.
[3]
丁云花,Holger Budahn,赵泓,赵岫云. 甘蓝型油菜- 萝卜C染色体附加系与普通白菜杂交F1 的SSR标记鉴定 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(8): 46-50.
[4]
王君,李衍素,张爱民,孟雷,张胜丰,于贤昌. 外保温覆盖大跨度塑料大棚在徐淮地区番茄越冬生产上的实践 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(8): 51-57.
[5]
刘宇曦,王娟娟,武隆楷,李衍素,贺超兴,于贤昌,王君. 不同追氮量对日光温室樱桃番茄品质、生长和氮素利用效率的影响 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(7): 40-47.
[6]
陈光鑫,丁栋,李倩,陈迎雪,王叶宁,吕晨希,高洪波,吴晓蕾. GABA 和CaCl2 复配对盐碱胁迫下番茄幼苗生长、叶绿素荧光参数和活性氧的影响 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(7): 48-55.
[7]
赵立华 朱阳阳 邱润霜 李博文 李 靖 董家红. 辣椒抗番茄环纹斑点病毒的种质资源筛选 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(6): 80-84.
[8]
田培洁,李诗君,张宇,刘勇,张松柏,张德咏. 侵染番茄的曲叶病毒检测及遗传变异分析 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(5): 28-32.
[9]
兰梅,张丽琴,胡靖锋,徐学忠,杨红丽,和江明. 基于BSA-SSR技术初步筛选与叶用芥菜莱菔硫烷含量相关的分子标记 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(5): 33-38.
[10]
田茂燕,向婷颖,钟川,王鹏,阳燕娟,于文进. 番茄砧木耐热性评价及热胁迫生理响应研究 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(5): 39-47.
[11]
张萌,翟乾行,朱承余,郑丽宁,张浩. 荧光假单胞菌YG-1与杀菌剂复配对番茄灰霉病的联合毒力 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(5): 70-74.
[12]
阮美颖,周国治,王荣青,叶青静,钟洋敏,姚祝平,万红建,李志邈,陶佳翠. 抗TYLCV樱桃番茄新品种浙樱粉3号的选育 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(5): 94-96.
[13]
程 琳 张晓艳 魏美甜 伦尧尧 赵 静 王晓武 李传友. 与番茄颈腐根腐病紧密连锁的SCAR 标记开发 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(3): 36-42.
[14]
刘湘萍 杜敏霞 赵 彦 王葆生 刘 燕 廉 勇 狄洁增 徐卫忠. 洋葱种质资源遗传多样性的SRAP 和ISSR 分析 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(3): 43-49.
[15]
李君明,项朝阳,王孝宣,国艳梅,黄泽军,刘磊,李鑫,杜永臣. “十三五”我国番茄产业现状及展望 [J]. 中国蔬菜, 2021, 1(2): 13-20.