数量性状关联分析及其在蔬菜中的应用
陈秀辰,杨旭,成玉富,薛林宝,陈学好
1扬州大学园艺与植物保护学院,江苏扬州 225009|2扬州市沿江农业科技有限公司,江苏扬州 225000
Association Analysis for Quantitative Traits and Its Application in Vegetable Crops
CHEN Xiu-chen1,YANG Xu1,2*,CHENG Yu-fu1,XUE Lin-bao1,CHEN Xue-hao1
1College of Horticulture & Plant Protection,Yangzhou University,Yangzhou 225009,Jiangsu,China|2Yangzhou Yanjiang Agricultural Science & Technology Co.?Ltd.,Yangzhou 225000,Jiangsu,China
摘要 关联分析是在植物数量性状研究和植物育种中应用的一种新的分析方法,它以连锁不平衡(LD)为基础鉴定某一群体内性状与遗传标记或候选基因间的关系。这一方法也为蔬菜作物中数量性状的研究提供了新思路。本文主要介绍了关联分析的基础、研究策略,简述了关联分析在蔬菜研究中的应用和进展,并对其未来发展和在蔬菜育种研究中的应用进行了展望。
关键词 :
关联分析 ,
连锁不平衡 ,
数量性状 ,
综述
Abstract :Recently,association analysis has been widely employed to investigate quantitative traits in plant genetics and breeding.It is an approach to identify the relationship of molecular markers or candidate genes with traits in a given population based on linkage disequilibrium(LD).This approach is also a new idea for the study of quantitative traits in vegetable crops.In this paper,the basic statistic principles,strategies,and current successful applications of association analysis in vegetable crops were reviewed.The potential application of association analysis in vegetable crops molecular breeding were also discussed.
Key words :
Association analysis
Linkage disequilibrium(LD)
Quantity trait locus(QTL)
Review
收稿日期: 2012-03-26
出版日期: 2012-04-28
基金资助: 国家自然科学基金项目(31171954),国家科技支撑计划项目(2009BADB8B01),中国博士后基金项目(20110491463),江苏省自然科学基金项目(BK2010320)
通讯作者:
杨旭,男,副教授,硕士生导师,专业方向:蔬菜遗传育种与生物技术,E-mail:yangxu@yzu.edu.cn
作者简介 : 陈秀辰,女,硕士研究生,专业方向:蔬菜分子育种,E-mail:eddo_chenxiuchen@126.com
引用本文:
陈秀辰,杨旭,成玉富,薛林宝,陈学好. 数量性状关联分析及其在蔬菜中的应用[J]. 中国蔬菜, 2012, 1(16): 1-9.
CHEN Xiu-chen1,YANG Xu1,2*,CHENG Yu-fu1,XUE Lin-bao1,CHEN Xue-hao1. Association Analysis for Quantitative Traits and Its Application in Vegetable Crops. , 2012, 1(16): 1-9.
链接本文:
http://www.cnveg.org/CN/ 或 http://www.cnveg.org/CN/Y2012/V1/I16/1
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